عند التعامل مع أجهزة الكمبيوتر، يمكن أن تنشأ مشاكل فنية عدة عند الانتهاء من إدخال البيانات أو أثناء إدخالها، قد تواجه مشاكل مثل، انقطاع التيار الكهربائي وقد تصاب أجهزة الكمبيوتر بفيروس؛ مما يُساهم في استغرق الوقت للتراجع عن الخطأ أو إرجاع البيانات المفقودة.
المراجعة: تُعرض معلومات ميزان المراجعة بشكل دوري وفوري في المحاسبة الإلكترونية، بينما يتم إعداده عند الحاجة في المحاسبة التقليدية.
مع جميع مزايا نظام المحاسبة عبر الإنترنت، يمكن لأصحاب الأعمال والشركات تصميم نظام الرقابة الداخلية الخاص بهم وزيادة فعالية هذه الرقابة والتي تعد من أهم مهام المحاسبة الإدارية، وذلك عند استخدامهم المحاسبة الإلكترونية.
لذا فإنه لا بُد من الأخذ بعين الاعتبار الدور الهام الذي تلعبه المُحاسبة الإلكترونية كونها تُمثل دورًا هامًا في الرقابة نظرًا للكفاءة والشفافية التي تُتيحها كما أن جميع المعلومات والبيانات ستكون مُتاحة لمن يحتاج للاطلاع عليها والتدقيق فيها والبحث عن أوجه الفساد التي رُبما ستكون موجودة، وبالتالي يُمكن التقليص من الفساد المالي باستخدام المُحاسبة الإلكترونية. المراجع[+]
تفتح أنظمة المحاسبة الإلكترونية الباب أمام إمكانية التلاعب بالبيانات المالية، سواءً من قبل موظفين داخليين أو هاكرز خارجيين، مما ينذر بتحديات أمنية وأخلاقية قد تؤدي إلى كوارث مالية للشركة وتأثيرات سلبية على سمعتها.
مراقبة الأنماط غير الطبيعية في التدفقات النقدية أو السجلات المالية.
إمكانية الربط مع الحسابات المصرفية والفروع المتعددة للمنشأة
استخدام التطبيقات المحاسبية السحابية لإعداد التقارير المالية الحكومية بشكل موحد ومتكامل، وتحسين الشفافية والمراقبة من خلال الوصول إلى البيانات في أي وقت.
في المحاسبة المحاسبة الالكترونية التقليدية، يتم تسجيل كل تفاصيل المحاسبة في دفتر يومي وسجل معاملات مفصل، من ناحية أخرى، فإن قاعدة البيانات وبرامج المحاسبة هي أصل المحاسبة الالكترونية.
برامج و أنظمة الحوسبة السحابية التي تعتمد على تخزين ومعالجة البيانات من خلال استضافتها على مواقع الانترنت و خوادم الويب.
أي نظام يعمل بشكل إلكتروني فهو عرضة لمواجهة مشاكل فنية في أي وقت، وبالمثل، أثناء استخدام برنامج المحاسبة الإلكترونية، يمكن أيضًا مواجهة العديد من الأخطاء الفنية مثل مشكلات الخادم، وانقطاع التيار الكهربائي، وأخطاء البرامج، وما إلى ذلك.
النسخ الاحتياطية: يمكن إجراء نسخ احتياطية للبيانات بشكل تلقائي ومنتظم، بينما تتطلب المحاسبة التقليدية جهودًا إضافية لإعداد نسخ احتياطية يدويًا.
حُدوث فشل نور في النظام: إن مخاطر التعطل التي يُمكن أن تتعرض لها أجهزة الكُمبيوتر قد تكون أحد أهم سلبيات المُحاسبة الإلكترونية كونها تُؤدي لفقدان العمل وخاصةً عندما لا يتم الاحتفاظ بنسخة احتياطية، وهذا الذي بدوره سيُؤدي إلى استهلاك الوقت في حال عدم وجود نُسخة احتياطية.
ميزات متقدمة: يوفر البرنامج مجموعة واسعة من الميزات المتقدمة لإدارة جميع جوانب النشاط التجاري، بما في ذلك: